Research laboratory services (Франция - Тендер #42849341) | ||
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Страна: Франция (другие тендеры и закупки Франция) Организатор тендера: CNRS Délégation Occitanie Est Номер конкурса: 42849341 Дата публикации: 16-06-2023 Сумма контракта: 14 757 111 (Российский рубль) Цена оригинальная: 250 000 (Евро) Источник тендера: Единая система закупок Европейского союза TED |
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Prestations de séquençage
Reference number: 2023-CEFE-02L"objet du présent accord-cadre est de produire des ressources génétiques et des ensembles de données pour les espèces Timema. Il comprend le reséquençage de génomes entiers (WGRS), la production de plusieurs génomes de référence, le séquençage de mécanismes épigénétiques et le génotypage par séquençage (ddRAD) de phasmes du genre Timema. Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Reséquençage de génomes entiers de phasmes du genre Timema
Lot No: 1CENTRE D’ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE – UMR 5175
1919, Route de Mende
34293 MONTPELLIER
Cette prestation vise à imputer les séquences du génome entier d"individus du genre Timema en utilisant un reséquençage profond (10x) du génome entier d"individus, afin de prédire la séquence du génome entier d"autres individus avec un séquençage à couverture 0,5x. Le titulaire assurera la préparation des bibliothèques et le séquençage de ces bibliothèques. Les extractions d"ADN seront envoyées par transporteur en différents lots d"une centaine d"échantillons à la fois.
Le présent accord-cadre sera conclu pour une durée initiale de 12 mois à compter de sa notification.
Il est reconduit tacitement jusqu"à son terme. Le présent marché ne pourra faire l’objet que d’une seule reconduction La durée d’une période de reconduction est de 12 mois. La durée maximale du contrat est de 24 mois. Les modalités sont décrites à l"art. 4 du CCAP.
Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Production de génomes références d’espèces de phasmes du genre Timema
Lot No: 2CENTRE D’ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE – UMR 5175
1919, Route de Mende
34293 MONTPELLIER
Le présent lot a pour objet le séquençage de génomes de référence avec un assemblage à l"échelle chromosomique et avec résolution des haplotypes. Nous demandons plusieurs génomes de référence pour différents morphes (avec différents motifs dorsaux) dans différentes espèces du genre Timema.
Le présent accord-cadre sera conclu pour une durée initiale de 12 mois à compter de sa notification.
Il est reconduit tacitement jusqu"à son terme. Le présent marché ne pourra faire l’objet que d’une seule reconduction La durée d’une période de reconduction est de 12 mois. La durée maximale du contrat est de 24 mois. Les modalités sont décrites à l"art. 4 du CCAP.
Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Séquençage de mécanismes épigénétiques de phasmes du genre Timema
Lot No: 3CENTRE D’ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE – UMR 5175
1919, Route de Mende
34293 MONTPELLIER
La prestation vise à réaliser des tests épigénétiques chez T. cristinae à partir de populations de plantes hôtes différentes – qui définissent les écotypes. Nous prévoyons d"obtenir des données pour des spécimens de différentes plantes hôtes sur :
1) Le statut de méthylation de l"ADN en utilisant la technique WGBS ;
2) La carte d"accessibilité de la chromatine à haute résolution en utilisant la technique ATAC-seq;
3) L’organisation tridimensionnelle de la chromatine et une carte génomique des interactions entre les loci utilisant la technique Hi-C;
4) Carte des modifications des histones à l"aide de ChIP-seq;
5) Des modèles d"expression utilisant la technique RNA-seq;
6) Évaluer la structure génétique qui sous-tend ces structures épigénétiques à l"aide du WGS. Nous fournirons les tissus d"insectes et le fournisseur de services se chargera d"effectuer les différents traitements (i.e., bisulfite, ATAC, capture de la conformation de la chromatine) suivi d"un séquençage à haute résolution.
Le présent accord-cadre sera conclu pour une durée initiale de 12 mois à compter de sa notification.
Il est reconduit tacitement jusqu"à son terme. Le présent marché ne pourra faire l’objet que d’une seule reconduction La durée d’une période de reconduction est de 12 mois. La durée maximale du contrat est de 24 mois. Les modalités sont décrites à l"art. 4 du CCAP.
Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Génotypage par séquençage des librairies hautes diversités de phasmes du genre Timema
Lot No: 4CENTRE D’ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE – UMR 5175
1919, Route de Mende
34293 MONTPELLIER
L’objet du présent contrat est de génotyper par séquençage des individus de l"espèce Timema cristinae. Nous fournirons au titulaire des librairies prêtes. Le prestataire réalisera le séquençage de ces librairies.
Le présent accord-cadre sera conclu pour une durée initiale de 12 mois à compter de sa notification.
Il est reconduit tacitement jusqu"à son terme. Le présent marché ne pourra faire l’objet que d’une seule reconduction La durée d’une période de reconduction est de 12 mois. La durée maximale du contrat est de 24 mois. Les modalités sont décrites à l"art. 4 du CCAP.
Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Se référer au Dossier de Consultation des Entreprises (DCE).
• Référé précontractuel prévu aux articles L. 551-1à L. 551-12 du code de justice administrative (CJA), pouvant être introduit depuis le début de la procédure de passation jusqu’à la signature du marché ;
• Référé contractuel prévu aux articles L. 551-13 à L. 551-23 du CJA, pouvant être exercé dans les délais prévus à l"article R. 551-7 du CJA ;
• Recours de pleine juridiction contestant la validité du marché dans un délai de 2 mois à compter de l"accomplissement des mesures de publicité appropriées au sens de la décision Département de Tarn-et-Garonne (CE, Ass., 4 avril 2014, n°358994). Ce recours en contestation de validité peut être assorti d"une demande tendant, sur le fondement de l"article L. 521-1 du code de justice administrative, à la suspension de l"exécution du contrat.
• Référé précontractuel prévu aux articles L. 551-1à L. 551-12 du code de justice administrative (CJA), pouvant être introduit depuis le début de la procédure de passation jusqu’à la signature du marché ;
• Référé contractuel prévu aux articles L. 551-13 à L. 551-23 du CJA, pouvant être exercé dans les délais prévus à l"article R. 551-7 du CJA ;
• Recours de pleine juridiction contestant la validité du marché dans un délai de 2 mois à compter de l"accomplissement des mesures de publicité appropriées au sens de la décision Département de Tarn-et-Garonne (CE, Ass., 4 avril 2014, n°358994). Ce recours en contestation de validité peut être assorti d"une demande tendant, sur le fondement de l"article L. 521-1 du code de justice administrative, à la suspension de l"exécution du contrat.
Tribunal administratif de Montpellier