91.2025 Wykonanie analizy transkryptomu na skrawkach tkanek utrwalonych w parafinie na potrzeby Zakładu Histologii i Embriologii Uniwersytetu Medycznego im. Piastów Śląskich we Wrocławiu (Польша - Тендер #72315153) | ||
| ||
| Для перевода текста тендера на нужный язык воспользуйтесь приложением: | ||
Страна: Польша (другие тендеры и закупки Польша) Организатор тендера: Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu Номер конкурса: 72315153 Дата публикации: 12-05-2026 Источник тендера: ezamowienia.gov.pl |
||
Zamówienie klasyczne - od 130 000 zł, ale o wartości mniejszej niż progi unijne
Tak
Środki Krajowego Programu Odbudowy w ramach umowy nr: 2024/ABM/03/KPO/KPOD.07.07-IW.07-0071/24-00 pn.: „Ocena zmian profilu ekspresji genów zależnych od PIP (prolactin-induced protein) w zależności od podtypu molekularnego raka gruczołu piersiowego w aspekcie odpowiedzi na chemioterapię" - Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu. Numer projektu: KPOD.07.07-IW.07-0071/24
Zamówienie udzielane jest w trybie podstawowym na podstawie: art. 275 pkt 1 ustawy
Usługi
91.2025 Wykonanie analizy transkryptomu na skrawkach tkanek utrwalonych w parafinie na potrzeby Zakładu Histologii i Embriologii Uniwersytetu Medycznego im. Piastów Śląskich we Wrocławiu
1. Przedmiotem zamówienia jest wykonanie analizy transkryptomu na skrawkach tkanek utrwalonych w parafinie na potrzeby Zakładu Histologii i Embriologii Uniwersytetu Medycznego im. Piastów
Śląskich we Wrocławiu.
2. Krótki opis przedmiotu zamówienia:
Przedmiot zamówienia obejmuje:
1) Wykonanie analizy molekularnej o rozdzielczości subkomórkowej na skrawkach tkanek FFPE, tkanki w postaci mikromacierzy tkankowych, brak konieczności optymalizacji próbek przed
analizą.
2) Analizę ludzkich tkanek nowotworu piersi z wykorzystaniem systemu do analizy opartego o dedykowane, wysoce specyficzne sondy i odczyt sygnału fluorescencyjnego.
3) Wykonanie analizy dla minimum 20 skrawków, przeanalizowanie minimum 47cm2 tkanki.
4) Dla każdej próbki analiza przynajmniej 280 genów ludzkich - gotowy panel sond zaprojektowany i przetestowany przez producenta.
5) Możliwość dodania do 100 genów do analizowanej puli, w tym możliwość zaprojektowania sond do wykonania izoform, transgenów i translokacji.
6) Analizę o rozdzielczości subkomórkowej, precyzja lokalizacji transkryptu w płaszczyźnie xy nie gorsza niż 30 nm, dla każdego wykrytego transkryptu muszą być podane współrzędne
xyz.
7) W celu precyzyjnego wykrycia komórek segmentacja oparta na minimum 3 lub 4 poziomowym systemie barwienia: jąder komórkowych i/lub białek błonowych i/lub cytoplazmatycznych i/lub 18S r
RNA.
8) Proces analizy nie może mieć niszczącego wpływu na analizowaną tkankę, aby po zakończeniu analizy była możliwość wykonania barwienia H&E lub immunofluorescencji dokładnie na
tym samym, badanym skrawku.
9) Wykorzystany do analizy system, na podstawie zebranych sygnałów fluorescencyjnych, musi automatycznie wykonywać analizę danych, to znaczy: segmentację i klastrowanie komórek,
wykonywanie transkryptów i wizualizowanie ich lokalizacji na tkance, podawanie liczby wykrytych transkryptów. Przeanalizowane dane dostarczone w takiej formie, że nie jest konieczna
zaawansowana analiza bioinformatyczna.
10) Wyniki analizy/badania przygotowywane przez Wykonawcę w formacie nie wymagającym zakupy dodatkowego oprogramowania przez Zamawiającego. Producent systemu do analizy musi udostępniać
darmowe, bez limitu licencji, oprogramowanie do wizualizacji, automatycznie przeanalizowanych wyników, które można pobrać bezpośrednio z jego strony internetowej. Oprogramowanie
niewymagające dedykowanego komputera o dużej mocy obliczeniowej.
11) Oprogramowanie do wizualizacji musi również umożliwiać pobranie zdjęcia po barwieniu H&E lub IF i nałożenie na zdjęcie wyników analizy molekularnej.
12) Przekazywane przez Wykonawcę dane musza być w formacie otwartym, umożliwiającym ich wykorzystanie w innych, komercyjnie dostępnych, oprogramowaniach.
13) skrojony i nałożony na slajdy materiał może być dostarczony jednorazowo lub etapami w zależności od wymagań wykonawcy, uzyskane wyniki wykonawca będzie dostarczać każdorazowo po
zakończeniu partii badań wraz z odesłaniem slajdów ze skrawkami.
14) Czas na wykonanie przedmiotu zamówienia maksymalnie do dnia 15.12.2025 r. lub do dnia przekazania Zamawiającemu wszystkich wyników badań.
15) Zamawiający w celu realizacji przedmiotu zamówienia, zapewni Wykonawcy odczynniki do analizy transkryptomu na skrawkach tkanek utrwalonych w parafinie firmy 10XGenomiscs.
3. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia, w tym warunki i zasady realizacji tego przedmiotu zamówienia, określa Wzór umowy (załącznik nr 3 do SWZ).
73120000-9 - Usługi eksperymentalno-rozwojowe
nie dotyczy